麻醉科、手术室是医院的核心科室。
始建于1996年医院成立之际，当时手术间仅有20平方米，配备有麻醉呼吸机、无影灯、高频电刀、手术显微镜、多参数心电监护仪等能开展一般手术的设施。
1998年医院搬迁到溢水路88号，在病房楼二楼建两个30平方米的手术间，按当时手术室标准建有清创间、消毒间、洗手间、更衣室、值班室等，总面积达220平方米。
2008年11月，随着医院规模扩大，按照新的手术室标准又新建三个35平方米手术间，分别为普通手术间、感染手术间，无菌手术间，并严格按照污染区、半污染区、无菌区隔离，总面积达350平方米。手术间配置有多功能电动手术床、注射泵、手术显微镜、C臂、脑立体定向仪、呼吸机、麻醉深度监护仪、无影灯、高频电刀、腹腔镜、双极电凝、低温等离子灭菌器、心电图机、呼吸末二氧化碳监测仪等先进设备。

目前，麻醉科、手术室能满足脑外、胸外、普外、泌尿、骨科、妇产科等各类手术需求。